El Centro Estatal de Trasplantes es un órgano desconcentrado de la Secretaría de Salud, con autonomía técnica y administrativa, y tiene a su cargo las funciones siguientes:
* Decidir y vigilar la asignación de órganos, tejidos y células;
* Participar en el Consejo Nacional de Trasplantes;
* Proporcionar al Registro Nacional de Trasplantes la información correspondiente a la entidad y su actualización;
* Promover el diseño, instrumentación y operación del sistema estatal de trasplantes;
* Proponer políticas, estrategias y acciones para la elaboración y aplicación de los programas en materia de trasplantes;
* Sugerir a las autoridades competentes la realización de actividades de investigación y difusión para el fomento de la cultura de la donación de órganos, tejidos y células;
* Establecer los mecanismos para la sistematización y difusión entre los sectores involucrados de la normatividad y de la información científica, técnica y sanitaria en materia de trasplantes;
* Coordinar las acciones de las dependencias y organismos auxiliares de la administración pública del Estado, en la instrumentación de los programas nacional y estatal en materia de trasplantes, así como promover la concertación de acciones con las instituciones de los sectores social y privado que lleven a cabo tareas relacionadas con los programas mencionados;
* Coordinar sus acciones con los registros Nacional y Estatal de Trasplantes;
* Proponer mecanismos de evaluación de los programas de capacitación y atención médica relacionados con los trasplantes;
* Coadyuvar con las autoridades competentes en la prevención del tráfico ilegal de órganos, tejidos y células;
* Proponer mecanismos de vigilancia y control en la donación de órganos, tejidos y células;
* Crear comisiones para el estudio de las diversas materias de salud relacionadas con trasplantes;
* Organizar, coordinar y vigilar el ejercicio de las actividades profesionales, técnicas y auxiliares de la salud en materia de disposición de órganos, tejidos y células con fines de trasplantes;
* Proponer a la Secretaría de Salud del Gobierno Federal y al Centro Nacional de Trasplantes, la revocación de la autorización sanitaria o cancelación del registro de los establecimientos y profesionales dedicados a la disposición de órganos, tejidos y células con fines de trasplantes;
* Proponer a la Secretaría de Salud acuerdos de colaboración interinstitucional en materia de trasplantes;
* Las demás que se determinen en los acuerdos de coordinación respectivos.